Si ricorre alla fisioterapia allorché eventi come traumi, paralisi, vecchiaia ed una lunga degenza a letto hanno provocato atrofia (grave sofferenza, associata a riduzione delle dimensioni, del peso e dell'attività) o ipotrofia (riduzione dello sviluppo) dei muscoli.
Trattamenti particolari riguardano il ripristino della voce per i pazienti che hanno subito particolari interventi, che hanno compromesso tale funzione (ad esempio la laringectomia, ovvero l'asportazione parziale o totale della laringe, che è il primo tratto dell'apparato respiratorio), il ripristino della capacità di scrivere e di leggere, alteratasi a causa di alcune malattie del sistema nervoso, ed il recupero delle funzioni degli apparati respiratorio, digerente ed escretore.
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